Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps26aP40336 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps26aP40336 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps26aP40336 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps26aP40336 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps26aP40336 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms