Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mmp13P33435 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp13P33435 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp13P33435 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp13P33435 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms