Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdh15P33146 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdh15P33146 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdh15P33146 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdh15P33146 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdh15P33146 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh15P33146 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms