Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc5P32043 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc5P32043 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc5P32043 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms