Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxa10P31310 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxa10P31310 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa10P31310 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa10P31310 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa10P31310 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa10P31310 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa10P31310 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms