Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxc10P31257 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxc10P31257 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxc10P31257 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxc10P31257 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxc10P31257 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms