Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk4P30285 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk4P30285 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk4P30285 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk4P30285 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk4P30285 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk4P30285 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms