Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn10P28658 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn10P28658 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn10P28658 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn10P28658 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms