Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BrafP28028 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BrafP28028 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BrafP28028 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BrafP28028 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrafP28028 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrafP28028 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrafP28028 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrafP28028 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrafP28028 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrafP28028 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrafP28028 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrafP28028 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrafP28028 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrafP28028 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BrafP28028 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrafP28028 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrafP28028 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrafP28028 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrafP28028 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrafP28028 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrafP28028 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrafP28028 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrafP28028 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrafP28028 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrafP28028 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrafP28028 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrafP28028 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrafP28028 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrafP28028 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrafP28028 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrafP28028 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrafP28028 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrafP28028 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrafP28028 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrafP28028 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrafP28028 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrafP28028 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BrafP28028 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BrafP28028 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrafP28028 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrafP28028 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrafP28028 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrafP28028 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrafP28028 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BrafP28028 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BrafP28028 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrafP28028 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrafP28028 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrafP28028 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BrafP28028 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrafP28028 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BrafP28028 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BrafP28028 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BrafP28028 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BrafP28028 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrafP28028 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BrafP28028 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrafP28028 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrafP28028 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrafP28028 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrafP28028 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrafP28028 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BrafP28028 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BrafP28028 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BrafP28028 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BrafP28028 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BrafP28028 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrafP28028 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrafP28028 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrafP28028 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrafP28028 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrafP28028 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrafP28028 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrafP28028 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrafP28028 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrafP28028 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrafP28028 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrafP28028 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrafP28028 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrafP28028 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms