Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NdnP25233 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NdnP25233 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NdnP25233 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NdnP25233 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NdnP25233 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NdnP25233 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NdnP25233 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NdnP25233 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NdnP25233 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NdnP25233 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NdnP25233 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NdnP25233 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NdnP25233 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NdnP25233 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NdnP25233 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NdnP25233 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NdnP25233 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NdnP25233 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NdnP25233 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NdnP25233 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NdnP25233 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NdnP25233 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NdnP25233 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NdnP25233 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NdnP25233 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NdnP25233 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NdnP25233 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NdnP25233 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NdnP25233 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NdnP25233 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NdnP25233 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NdnP25233 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NdnP25233 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NdnP25233 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NdnP25233 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NdnP25233 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NdnP25233 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NdnP25233 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NdnP25233 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NdnP25233 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NdnP25233 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NdnP25233 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NdnP25233 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NdnP25233 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NdnP25233 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NdnP25233 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NdnP25233 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NdnP25233 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NdnP25233 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NdnP25233 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NdnP25233 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NdnP25233 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NdnP25233 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NdnP25233 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NdnP25233 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NdnP25233 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NdnP25233 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NdnP25233 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NdnP25233 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NdnP25233 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NdnP25233 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NdnP25233 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NdnP25233 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NdnP25233 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NdnP25233 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NdnP25233 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NdnP25233 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NdnP25233 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NdnP25233 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NdnP25233 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NdnP25233 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NdnP25233 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NdnP25233 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NdnP25233 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms