Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfaP23607 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfaP23607 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZfaP23607 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZfaP23607 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfaP23607 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZfaP23607 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZfaP23607 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZfaP23607 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZfaP23607 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZfaP23607 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZfaP23607 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZfaP23607 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZfaP23607 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZfaP23607 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZfaP23607 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZfaP23607 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZfaP23607 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZfaP23607 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZfaP23607 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZfaP23607 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms