Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd8P23463 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd8P23463 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd8P23463 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd8P23463 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd8P23463 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms