Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6bP23440 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pde6bP23440 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde6bP23440 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde6bP23440 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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