Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggta1P23336 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ggta1P23336 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ggta1P23336 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms