Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmbsP22907 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmbsP22907 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmbsP22907 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmbsP22907 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmbsP22907 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmbsP22907 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmbsP22907 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmbsP22907 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmbsP22907 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HmbsP22907 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmbsP22907 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmbsP22907 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HmbsP22907 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HmbsP22907 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms