Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ntf3P20181 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ntf3P20181 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ntf3P20181 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms