Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lsp1P19973 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lsp1P19973 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lsp1P19973 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lsp1P19973 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms