Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Esr1P19785 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Esr1P19785 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Esr1P19785 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Esr1P19785 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Esr1P19785 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Esr1P19785 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Esr1P19785 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Esr1P19785 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esr1P19785 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esr1P19785 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms