Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Phka1P18826 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phka1P18826 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phka1P18826 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phka1P18826 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phka1P18826 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phka1P18826 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Phka1P18826 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phka1P18826 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phka1P18826 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phka1P18826 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phka1P18826 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Phka1P18826 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phka1P18826 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phka1P18826 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phka1P18826 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phka1P18826 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms