Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsdP18242 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsdP18242 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtsdP18242 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsdP18242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsdP18242 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtsdP18242 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtsdP18242 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsdP18242 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtsdP18242 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsdP18242 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsdP18242 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsdP18242 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsdP18242 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsdP18242 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsdP18242 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsdP18242 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms