Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Selenbp1P17563 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Selenbp1P17563 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Selenbp1P17563 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Selenbp1P17563 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms