Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp53P15975 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp53P15975 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp53P15975 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp53P15975 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp53P15975 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp53P15975 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp53P15975 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp53P15975 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp53P15975 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp53P15975 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp53P15975 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp53P15975 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp53P15975 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp53P15975 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms