Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prph2P15499 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prph2P15499 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prph2P15499 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prph2P15499 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prph2P15499 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prph2P15499 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prph2P15499 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prph2P15499 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prph2P15499 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prph2P15499 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prph2P15499 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prph2P15499 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prph2P15499 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prph2P15499 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prph2P15499 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prph2P15499 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prph2P15499 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prph2P15499 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prph2P15499 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prph2P15499 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prph2P15499 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prph2P15499 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prph2P15499 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prph2P15499 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prph2P15499 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prph2P15499 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prph2P15499 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prph2P15499 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prph2P15499 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prph2P15499 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prph2P15499 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prph2P15499 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prph2P15499 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prph2P15499 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prph2P15499 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prph2P15499 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prph2P15499 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prph2P15499 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prph2P15499 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prph2P15499 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prph2P15499 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prph2P15499 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prph2P15499 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prph2P15499 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prph2P15499 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms