Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RhoP15409 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RhoP15409 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RhoP15409 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RhoP15409 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RhoP15409 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RhoP15409 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RhoP15409 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RhoP15409 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RhoP15409 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RhoP15409 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RhoP15409 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RhoP15409 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RhoP15409 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RhoP15409 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RhoP15409 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RhoP15409 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RhoP15409 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RhoP15409 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RhoP15409 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RhoP15409 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RhoP15409 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RhoP15409 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RhoP15409 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RhoP15409 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RhoP15409 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RhoP15409 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RhoP15409 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhoP15409 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhoP15409 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhoP15409 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhoP15409 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RhoP15409 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RhoP15409 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RhoP15409 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RhoP15409 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RhoP15409 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RhoP15409 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RhoP15409 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RhoP15409 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RhoP15409 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RhoP15409 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhoP15409 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhoP15409 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhoP15409 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RhoP15409 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RhoP15409 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhoP15409 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhoP15409 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhoP15409 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhoP15409 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhoP15409 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RhoP15409 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhoP15409 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhoP15409 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhoP15409 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhoP15409 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RhoP15409 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RhoP15409 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RhoP15409 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RhoP15409 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RhoP15409 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RhoP15409 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RhoP15409 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RhoP15409 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RhoP15409 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RhoP15409 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RhoP15409 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RhoP15409 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RhoP15409 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RhoP15409 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RhoP15409 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RhoP15409 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RhoP15409 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RhoP15409 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhoP15409 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhoP15409 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhoP15409 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RhoP15409 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RhoP15409 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RhoP15409 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RhoP15409 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RhoP15409 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RhoP15409 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms