Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrm1P12657 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrm1P12657 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrm1P12657 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chrm1P12657 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrm1P12657 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.9 ms