Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sub1P11031 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sub1P11031 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sub1P11031 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sub1P11031 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sub1P11031 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sub1P11031 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sub1P11031 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sub1P11031 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sub1P11031 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sub1P11031 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sub1P11031 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms