Protein–RNA interactions for Protein: P10749

Il1b, Interleukin-1 beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1bP10749 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il1bP10749 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il1bP10749 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il1bP10749 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1bP10749 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1bP10749 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Il1bP10749 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Il1bP10749 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1bP10749 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1bP10749 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Il1bP10749 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Il1bP10749 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Il1bP10749 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1bP10749 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1bP10749 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1bP10749 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1bP10749 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Il1bP10749 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Il1bP10749 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms