Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl2P10148 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl2P10148 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl2P10148 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl2P10148 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl2P10148 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccl2P10148 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl2P10148 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl2P10148 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl2P10148 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms