Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem254aP0DN89 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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