Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Jmjd7P0C872 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Jmjd7P0C872 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd7P0C872 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Jmjd7P0C872 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Jmjd7P0C872 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms