Protein–RNA interactions for Protein: P09813

Apoa2, Apolipoprotein A-II, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa2P09813 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa2P09813 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa2P09813 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoa2P09813 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apoa2P09813 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Apoa2P09813 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Apoa2P09813 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa2P09813 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa2P09813 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa2P09813 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa2P09813 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa2P09813 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apoa2P09813 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa2P09813 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa2P09813 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa2P09813 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apoa2P09813 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa2P09813 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa2P09813 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa2P09813 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa2P09813 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apoa2P09813 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa2P09813 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa2P09813 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apoa2P09813 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa2P09813 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa2P09813 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa2P09813 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa2P09813 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa2P09813 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apoa2P09813 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa2P09813 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apoa2P09813 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa2P09813 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apoa2P09813 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apoa2P09813 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms