Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Polr2aP08775 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Polr2aP08775 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr2aP08775 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Polr2aP08775 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Polr2aP08775 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Polr2aP08775 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Polr2aP08775 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr2aP08775 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Polr2aP08775 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr2aP08775 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr2aP08775 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr2aP08775 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Polr2aP08775 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr2aP08775 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr2aP08775 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Polr2aP08775 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr2aP08775 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Polr2aP08775 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Polr2aP08775 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr2aP08775 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Polr2aP08775 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Polr2aP08775 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr2aP08775 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr2aP08775 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms