Protein–RNA interactions for Protein: P07742

Rrm1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm1P07742 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrm1P07742 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rrm1P07742 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrm1P07742 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrm1P07742 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrm1P07742 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrm1P07742 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrm1P07742 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrm1P07742 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrm1P07742 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrm1P07742 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrm1P07742 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms