Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-T23P06339 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-T23P06339 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-T23P06339 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-T23P06339 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-T23P06339 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-T23P06339 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-T23P06339 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms