Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01822 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01822 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01822 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01822 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01822 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01822 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01822 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01822 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
P01822 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01822 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01822 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01822 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01822 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01822 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01822 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01822 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01822 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01822 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01822 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01822 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
P01822 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01822 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01822 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01822 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01822 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01822 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
P01822 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01822 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01822 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01822 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01822 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01822 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01822 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01822 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01822 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01822 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01822 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01822 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01822 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01822 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
P01822 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01822 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01822 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01822 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01822 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01822 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
P01822 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01822 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01822 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01822 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01822 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01822 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
P01822 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01822 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
P01822 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
P01822 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P01822 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01822 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01822 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01822 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01822 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P01822 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01822 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01822 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01822 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01822 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01822 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01822 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P01822 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
P01822 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01822 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01822 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01822 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01822 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01822 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01822 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01822 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01822 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
P01822 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
P01822 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
P01822 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
P01822 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
P01822 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
P01822 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms