Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01794 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01794 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01794 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01794 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01794 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01794 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01794 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01794 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01794 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01794 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01794 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01794 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01794 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01794 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01794 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01794 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01794 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01794 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01794 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01794 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01794 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01794 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01794 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01794 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01794 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01794 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01794 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01794 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01794 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01794 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01794 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01794 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01794 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01794 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01794 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P01794 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01794 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01794 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01794 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01794 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01794 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01794 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01794 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01794 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01794 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01794 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01794 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01794 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01794 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01794 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01794 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01794 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01794 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01794 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01794 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01794 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01794 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01794 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01794 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01794 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01794 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01794 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01794 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01794 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01794 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01794 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01794 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01794 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01794 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01794 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01794 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01794 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01794 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.6 ms