Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01653 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01653 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01653 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01653 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01653 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01653 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01653 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01653 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
P01653 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01653 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01653 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01653 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P01653 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01653 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01653 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01653 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01653 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01653 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01653 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P01653 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01653 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
P01653 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01653 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01653 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01653 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01653 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01653 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01653 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01653 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01653 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01653 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P01653 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P01653 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01653 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P01653 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01653 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01653 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01653 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P01653 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01653 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01653 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01653 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01653 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01653 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P01653 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P01653 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01653 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01653 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01653 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P01653 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01653 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
P01653 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01653 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01653 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01653 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01653 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01653 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01653 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01653 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01653 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01653 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
P01653 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01653 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01653 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01653 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
P01653 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01653 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01653 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01653 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01653 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01653 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01653 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01653 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01653 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01653 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01653 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01653 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
P01653 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01653 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
P01653 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01653 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01653 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01653 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01653 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01653 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01653 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01653 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01653 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
P01653 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01653 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01653 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01653 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01653 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01653 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01653 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01653 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01653 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01653 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
P01653 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms