Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lancl1O89112 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl1O89112 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl1O89112 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl1O89112 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl1O89112 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lancl1O89112 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lancl1O89112 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lancl1O89112 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lancl1O89112 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lancl1O89112 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lancl1O89112 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl1O89112 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl1O89112 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl1O89112 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lancl1O89112 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lancl1O89112 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl1O89112 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl1O89112 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl1O89112 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl1O89112 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl1O89112 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lancl1O89112 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lancl1O89112 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lancl1O89112 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lancl1O89112 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lancl1O89112 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms