Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh3pxd2aO89032 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3pxd2aO89032 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2aO89032 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3pxd2aO89032 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms