Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
JtbO88824 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
JtbO88824 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
JtbO88824 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
JtbO88824 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
JtbO88824 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
JtbO88824 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
JtbO88824 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
JtbO88824 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
JtbO88824 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
JtbO88824 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JtbO88824 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JtbO88824 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JtbO88824 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JtbO88824 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JtbO88824 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
JtbO88824 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
JtbO88824 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JtbO88824 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JtbO88824 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JtbO88824 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JtbO88824 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
JtbO88824 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JtbO88824 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JtbO88824 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JtbO88824 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JtbO88824 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JtbO88824 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JtbO88824 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
JtbO88824 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JtbO88824 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JtbO88824 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JtbO88824 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JtbO88824 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JtbO88824 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JtbO88824 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JtbO88824 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JtbO88824 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JtbO88824 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JtbO88824 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JtbO88824 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JtbO88824 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JtbO88824 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JtbO88824 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JtbO88824 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JtbO88824 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
JtbO88824 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JtbO88824 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
JtbO88824 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
JtbO88824 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JtbO88824 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JtbO88824 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JtbO88824 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JtbO88824 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JtbO88824 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JtbO88824 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JtbO88824 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JtbO88824 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JtbO88824 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JtbO88824 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JtbO88824 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JtbO88824 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JtbO88824 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JtbO88824 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JtbO88824 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JtbO88824 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JtbO88824 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JtbO88824 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
JtbO88824 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JtbO88824 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JtbO88824 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JtbO88824 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JtbO88824 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JtbO88824 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
JtbO88824 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JtbO88824 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JtbO88824 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JtbO88824 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JtbO88824 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JtbO88824 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JtbO88824 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JtbO88824 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JtbO88824 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JtbO88824 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JtbO88824 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JtbO88824 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JtbO88824 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JtbO88824 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JtbO88824 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
JtbO88824 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JtbO88824 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JtbO88824 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms