Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh16O88338 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh16O88338 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh16O88338 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms