Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Eif6O55135 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Eif6O55135 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif6O55135 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif6O55135 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Eif6O55135 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Eif6O55135 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Eif6O55135 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif6O55135 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif6O55135 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif6O55135 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif6O55135 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif6O55135 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif6O55135 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Eif6O55135 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Eif6O55135 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif6O55135 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif6O55135 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif6O55135 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif6O55135 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif6O55135 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms