Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjd2O54851 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjd2O54851 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjd2O54851 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjd2O54851 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjd2O54851 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd2O54851 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjd2O54851 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms