Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DffaO54786 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DffaO54786 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DffaO54786 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DffaO54786 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DffaO54786 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DffaO54786 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DffaO54786 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DffaO54786 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DffaO54786 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DffaO54786 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DffaO54786 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DffaO54786 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DffaO54786 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DffaO54786 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DffaO54786 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DffaO54786 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DffaO54786 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DffaO54786 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DffaO54786 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DffaO54786 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DffaO54786 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DffaO54786 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DffaO54786 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DffaO54786 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DffaO54786 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DffaO54786 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DffaO54786 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DffaO54786 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DffaO54786 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DffaO54786 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DffaO54786 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DffaO54786 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DffaO54786 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DffaO54786 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DffaO54786 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DffaO54786 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DffaO54786 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DffaO54786 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DffaO54786 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DffaO54786 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DffaO54786 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DffaO54786 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DffaO54786 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DffaO54786 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DffaO54786 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DffaO54786 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DffaO54786 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DffaO54786 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DffaO54786 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DffaO54786 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DffaO54786 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DffaO54786 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DffaO54786 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DffaO54786 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DffaO54786 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DffaO54786 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DffaO54786 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DffaO54786 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DffaO54786 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DffaO54786 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DffaO54786 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DffaO54786 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DffaO54786 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DffaO54786 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DffaO54786 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DffaO54786 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DffaO54786 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DffaO54786 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DffaO54786 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DffaO54786 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DffaO54786 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DffaO54786 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DffaO54786 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DffaO54786 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DffaO54786 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DffaO54786 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DffaO54786 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DffaO54786 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DffaO54786 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DffaO54786 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DffaO54786 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DffaO54786 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DffaO54786 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DffaO54786 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DffaO54786 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DffaO54786 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DffaO54786 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DffaO54786 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DffaO54786 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DffaO54786 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DffaO54786 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DffaO54786 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DffaO54786 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DffaO54786 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DffaO54786 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DffaO54786 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DffaO54786 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DffaO54786 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DffaO54786 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms