Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdc4O35988 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sdc4O35988 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdc4O35988 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdc4O35988 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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