Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dsg3O35902 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dsg3O35902 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsg3O35902 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dsg3O35902 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dsg3O35902 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dsg3O35902 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms