Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CaluO35887 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CaluO35887 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CaluO35887 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CaluO35887 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CaluO35887 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CaluO35887 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CaluO35887 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CaluO35887 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CaluO35887 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CaluO35887 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CaluO35887 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CaluO35887 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CaluO35887 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CaluO35887 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CaluO35887 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CaluO35887 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CaluO35887 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CaluO35887 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CaluO35887 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CaluO35887 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CaluO35887 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CaluO35887 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CaluO35887 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CaluO35887 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CaluO35887 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CaluO35887 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CaluO35887 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CaluO35887 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CaluO35887 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CaluO35887 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CaluO35887 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CaluO35887 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CaluO35887 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CaluO35887 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CaluO35887 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CaluO35887 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CaluO35887 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CaluO35887 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CaluO35887 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CaluO35887 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CaluO35887 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CaluO35887 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CaluO35887 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CaluO35887 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CaluO35887 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CaluO35887 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CaluO35887 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CaluO35887 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CaluO35887 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CaluO35887 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CaluO35887 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CaluO35887 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CaluO35887 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CaluO35887 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CaluO35887 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CaluO35887 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CaluO35887 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CaluO35887 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CaluO35887 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CaluO35887 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CaluO35887 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CaluO35887 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CaluO35887 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CaluO35887 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CaluO35887 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CaluO35887 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CaluO35887 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CaluO35887 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CaluO35887 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CaluO35887 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CaluO35887 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CaluO35887 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CaluO35887 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CaluO35887 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CaluO35887 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CaluO35887 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CaluO35887 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CaluO35887 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CaluO35887 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CaluO35887 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CaluO35887 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CaluO35887 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CaluO35887 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CaluO35887 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CaluO35887 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CaluO35887 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CaluO35887 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CaluO35887 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CaluO35887 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CaluO35887 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CaluO35887 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CaluO35887 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CaluO35887 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CaluO35887 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CaluO35887 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CaluO35887 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CaluO35887 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CaluO35887 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CaluO35887 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms