Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf9O35739 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf9O35739 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf9O35739 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf9O35739 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf9O35739 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf9O35739 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf9O35739 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf9O35739 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf9O35739 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf9O35739 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf9O35739 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms