Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna3O35344 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna3O35344 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kpna3O35344 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kpna3O35344 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kpna3O35344 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kpna3O35344 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms