Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nedd9O35177 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nedd9O35177 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nedd9O35177 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nedd9O35177 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms